Прво, иако оба типа пречистача воде могу да пречисте нечистоће воде, њихови принципи пречишћавања нису исти. РО пречистач воде са реверзном осмозом је опремљен унутрашњом РО мембраном за реверзну осмозу. Под дејством притиска вода може да прође кроз РО мембрану, док су нечистоће као што су неорганске соли, јони тешких метала, бактерије и вируси блокирани мембраном реверзне осмозе.

Ултрафилтрациони пречистачи воде пречишћавају извор воде кроз своју унутрашњу ултрафилтрациону мембрану. Под притиском разлике притиска, извор воде може проћи кроз овај слој мембране и филтрирати нечистоће.

Два типа пречистача воде, који користе различите методе пречишћавања, имају одређене разлике у прецизности пречишћавања према својим принципима. РО пречистач воде са реверзном осмозом има РО мембрану унутра, а поре ове мембране су мале као нанометарски ниво. Чак и сићушни вируси и бактерије су хиљадама пута веће од пора РО мембране. Дакле, вода која пролази кроз РО мембрану у основи садржи само воду и никакве друге елементе, а филтрирана вода се може пити директно или кувана.

Ултрафилтрациони пречистач воде има ултрафилтрациону мембрану унутра, а опсег прецизности величине пора ове филтерске мембране је 0,01 ~ 0,001 μм, што је за један ред величине веће од оног код РО пречистача воде са реверзном осмозом. Истовремено, ултрафилтрациона мембрана не само да пропушта воду, већ и пропушта неке мале молекуларне супстанце са мањим запреминама, као што су неки минерални елементи.